儿科呼吸病专业建立于1978年，经过孙荟琴、林慈、李鸿仁、吴凤宝和张灵恩教授的努力，呼吸专业有了很大的发展。目前学科带头人为王立波主任医生，呼吸专科有22名专科医生，其中4名主任医生，6名副主任医生和8名主治医生。专科医生中博士学历有7名，硕士学历有12名，其中1名博士生导师，4名硕士生导师，具有完善的医疗和科研人才梯队。本专业侧重解决小儿呼吸道疾病的临床诊断、治疗和预防工作，重症疑难及罕见儿童肺部疾病诊治是学科发展的重点方向。
呼吸病专业有统一管理的呼吸病专业病区、呼吸专科门诊(包括儿童哮喘、慢性肺病专病门诊)，并配有纤维支气管镜室、肺功能室(包括常规肺功能、婴幼儿肺功能、婴幼儿体描、支气管激发试验、呼出气NO)、呼吸睡眠异常诊断中心、雾化治疗室及特异性免疫治疗室。借助于本院的辅助检查平台，能够对患儿进行免疫学、变态反应、病原学及病理学等方面检查，除了解决儿科常见病，如支气管哮喘、慢性咳嗽、反复呼吸道感染等的诊断、规范化治疗和临床指导外，重点解决儿童重症疑难和罕见肺部疾病的诊治。
呼吸专业除了承担医疗工作外，还需要进行医疗教育及科学研究工作；教学工作包括本科生、全英文、8年制学生、规培生、专科规培、进修医生、研究生及呼吸道疾病高级研修班等。近5年共获得19项课题研究基金项目，包括6项国家自然科学基金，发表论文30余篇，其中SCI论文10余篇。研究主要涉及儿童肺的早期发育以及发育异常的病理基础，婴幼儿呼吸道过敏的形成机制以及早期防治。
专科特色
1. 重症疑难及罕见肺部疾病的诊治：
难治性重症支原体肺炎及闭塞性支气管炎(单侧透明肺)的早期诊断与治疗
重症腺病毒肺炎及闭塞性细支气管炎防治
婴儿吸入性肺炎的诊断与临床处理
新生儿支气管肺发育不良的随访治疗
肺出血的鉴别诊断及特发性肺含铁血黄素沉积症的诊治
弥漫性间质性肺病的基因诊断与生育指导
弥漫性小气道分泌物潴积类疾病的诊断(弥漫性泛细支气管炎、肺囊性纤维化及纤毛不动综合征)的诊断与处理
2. 常见呼吸道疾病的规范治疗
儿童支气管哮喘的规范治疗
慢性咳嗽的病因诊断与治疗
婴幼儿喘息性疾病的诊治
反复呼吸道感染的诊治
3. 呼吸科临床新技术应用
纤维支气管镜及介入技术：包括三级及四级支气管镜技术，可以进行气道狭窄的球囊扩张、取异物、活检、冷冻或激光技术等
CT引导下经皮肺穿刺与胸腔镜下肺组织活检技术
同位素唾液吸入技术与吸入性肺炎诊断
疑难肺部疾病的基因诊断技术
弥漫性肺出血病因分析与介入治疗
高速显微镜检查技术
鼻部及支气管纤毛的电镜检查技术
鼻部NO检测技术
汗液氯离子检测技术
