流感病毒易变异的原因主要是因一个细胞被两种不同的流感病毒感染，基因出现重排，通过抗原漂移和抗原转化两种方式进行转变。所以发现感染流感病毒后，要及时治疗。
流感病毒属于分段RNA病毒，不同毒株间基因重组率很高，抗原变异频率快，变异主要通过抗原漂移和抗原转化两种方式进行转变。抗原漂移可引起HA和或NA的二次抗原变化，抗原转化可引起HA和或NA的原代抗原变化。
单点突变可改变表面蛋白的结构，从而改变其抗原或免疫特性，导致抗原变异。当一个细胞被两种不同的流感病毒感染时，病毒8个基因组片段可被随机交换为基因重排。通过基因重排可以产生高致病性菌株。基因重排不同于基因重组，只发生在同一种病毒之间，这就是为什么流感病毒容易变异。
