做肠镜检查时，医生会从肛门放入肠镜，然后循着肠道深入至回盲部，并通过目视目镜观察直肠到回盲部的肠道情况。
肠镜是一个比拇指微宽、前端带有光源的内镜，不仅可以观察肠道情况，还带有活检孔道，当医生发现息肉或者病变时，可直接在肠镜下取病理活检。但需注意，对于患者来说，做肠镜检查前最重要的是做好肠道准备，因为如果肠道内有大便，不但影响进镜，而且会影响医生观察，进而可能导致漏诊情况发生。
此外，肠镜检查与B超和CT等影像学检查不同。一是医生可以通过肠镜直观的去看肠道情况；二是肠镜相对而言属于有创性检查，所以肠镜没有被纳入常规体检项目，现在主要用于部分疾病的诊断。
如有需要，建议患者前往正规医院，在专业医生的指导下，接受规范的肠镜检查，以获得满意检查结果。